普通の女子高生・桜小路桜はある夜、青い炎で悪人を燃やす謎の少年を目撃する! しかし翌朝、現場となった公園には何の痕跡も残っていなかった。自分の見たものが現実だったのか思い悩む桜、その前に昨夜の少年が転校生として現れた!彼は何者なのか?そして青い炎は何だったのか? 謎を解くため桜は少年に近づいていく!!神田から、何者かに命を狙われていると告げられた桜。大神と刻は「コード:ブレイカー」として桜の命を護るという任務を受け桜小路家へ向かう。深夜、突然襲いかかって来たのは異様な技を持つ刺客たち! しかし大神と刻は激闘のさなか異能に異変をきたし意外な姿をさらす!! 絶対的不利のなか桜の命運は‥‥!?