Seele ist fest entschlossen, die EVAs zu vernichten und das NERV-Hauptquartier dem Erdboden gleichzumachen. Verzweifelt kämpfen die EVA-Piloten gegen die von allen Seiten anstürmenden Feinde an. Erst in allerletzter Sekunde kann Shinji Asuka zu Hilfe eilen. Doch die Children werden das Schlimmste kaum noch verhindern können: Welle um Welle dringen die Engel vor, der Third Impact scheint nicht mehr aufzuhalten. Doch Shinji ist bereit, sich dem Unvermeidlichen entgegenzustellen...