Apollonia Cox lebt in einem Leuchtturm an der wilden Küste Südenglands. Sehr zum Missfallen der örtlichen Behörden. Denn zur Schule geht das Mädchen kaum noch, seit ihre Eltern, die in einer Wetterstation arbeiteten, verschwunden sind. Als die Beamten Apollonia bei Nacht und Nebel in ein Kinderheim verfrachten wollen, stürzt sie sich todesmutig in die Tiefe - und stellt fest, dass sie fliegen kann. Eine abenteuerliche Reise beginnt. Zusammen mit ihren Freunden, den Wettergeistern, macht sich Apollonia auf die Suche nach ihren Eltern. Dabei muss sie gegen den bösartigen Raviel McMillan und seinem Komplizen Okami Dragon kämpfen. Die manipulieren das Wetter und wollen aus einer gigantischen Naturkatastrophe Profit schlagen. Aber sie haben nicht mit Apollonias unerschrockenem Mut und ihren magischen Kräften gerechnet...